Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PPFIA4O75335 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PPFIA4O75335 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms