Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C1D1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C1D1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C1D1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C1D1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C1D1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C1D1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C1D1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C1D1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C1D1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C1D1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C1D1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C1D1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C1D1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C1D1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C1D1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C1D1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C1D1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C1D1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C1D1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C1D1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C1D1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C1D1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C1D1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C1D1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C1D1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C1D1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C1D1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C1D1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C1D1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C1D1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C1D1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C1D1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C1D1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C1D1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C1D1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C1D1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C1D1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C1D1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C1D1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C1D1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C1D1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C1D1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C1D1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C1D1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C1D1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C1D1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C1D1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C1D1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C1D1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C1D1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C1D1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C1D1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C1D1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C1D1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H7C1D1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H7C1D1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C1D1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C1D1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C1D1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C1D1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C1D1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C1D1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C1D1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C1D1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C1D1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C1D1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C1D1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms