Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ERVV-2B6SEH9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms