Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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LINC00587B1AMM8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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LINC00587B1AMM8 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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LINC00587B1AMM8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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LINC00587B1AMM8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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LINC00587B1AMM8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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LINC00587B1AMM8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00587B1AMM8 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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LINC00587B1AMM8 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00587B1AMM8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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LINC00587B1AMM8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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