Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZNF316A6NFI3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF316A6NFI3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms