Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL33A6NCF5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL33A6NCF5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms