Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms