Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AireQ9Z0E3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AireQ9Z0E3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
AireQ9Z0E3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AireQ9Z0E3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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