Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN16Q9Y5I7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN16Q9Y5I7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN16Q9Y5I7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN16Q9Y5I7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN16Q9Y5I7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN16Q9Y5I7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN16Q9Y5I7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN16Q9Y5I7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN16Q9Y5I7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN16Q9Y5I7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN16Q9Y5I7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN16Q9Y5I7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN16Q9Y5I7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN16Q9Y5I7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN16Q9Y5I7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN16Q9Y5I7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN16Q9Y5I7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN16Q9Y5I7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN16Q9Y5I7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN16Q9Y5I7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN16Q9Y5I7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN16Q9Y5I7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN16Q9Y5I7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN16Q9Y5I7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN16Q9Y5I7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN16Q9Y5I7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN16Q9Y5I7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN16Q9Y5I7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN16Q9Y5I7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN16Q9Y5I7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN16Q9Y5I7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms