Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKAB1Q9Y478 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKAB1Q9Y478 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAB1Q9Y478 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAB1Q9Y478 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAB1Q9Y478 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKAB1Q9Y478 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAB1Q9Y478 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAB1Q9Y478 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKAB1Q9Y478 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAB1Q9Y478 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAB1Q9Y478 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAB1Q9Y478 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAB1Q9Y478 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAB1Q9Y478 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKAB1Q9Y478 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAB1Q9Y478 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAB1Q9Y478 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAB1Q9Y478 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAB1Q9Y478 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAB1Q9Y478 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAB1Q9Y478 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAB1Q9Y478 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKAB1Q9Y478 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAB1Q9Y478 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAB1Q9Y478 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKAB1Q9Y478 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKAB1Q9Y478 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKAB1Q9Y478 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAB1Q9Y478 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKAB1Q9Y478 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAB1Q9Y478 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAB1Q9Y478 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAB1Q9Y478 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKAB1Q9Y478 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAB1Q9Y478 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAB1Q9Y478 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAB1Q9Y478 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAB1Q9Y478 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKAB1Q9Y478 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAB1Q9Y478 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAB1Q9Y478 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKAB1Q9Y478 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB1Q9Y478 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB1Q9Y478 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB1Q9Y478 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB1Q9Y478 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB1Q9Y478 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB1Q9Y478 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB1Q9Y478 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB1Q9Y478 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB1Q9Y478 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB1Q9Y478 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKAB1Q9Y478 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAB1Q9Y478 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAB1Q9Y478 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKAB1Q9Y478 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAB1Q9Y478 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAB1Q9Y478 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAB1Q9Y478 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAB1Q9Y478 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAB1Q9Y478 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAB1Q9Y478 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAB1Q9Y478 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAB1Q9Y478 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAB1Q9Y478 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAB1Q9Y478 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAB1Q9Y478 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAB1Q9Y478 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAB1Q9Y478 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAB1Q9Y478 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAB1Q9Y478 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms