Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp21Q9QZL6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp21Q9QZL6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp21Q9QZL6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp21Q9QZL6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp21Q9QZL6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Usp21Q9QZL6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Usp21Q9QZL6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Usp21Q9QZL6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Usp21Q9QZL6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Usp21Q9QZL6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Usp21Q9QZL6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Usp21Q9QZL6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp21Q9QZL6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp21Q9QZL6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp21Q9QZL6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp21Q9QZL6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp21Q9QZL6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp21Q9QZL6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp21Q9QZL6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp21Q9QZL6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp21Q9QZL6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp21Q9QZL6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp21Q9QZL6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp21Q9QZL6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp21Q9QZL6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp21Q9QZL6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp21Q9QZL6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp21Q9QZL6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp21Q9QZL6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp21Q9QZL6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp21Q9QZL6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp21Q9QZL6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp21Q9QZL6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp21Q9QZL6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp21Q9QZL6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp21Q9QZL6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp21Q9QZL6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp21Q9QZL6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp21Q9QZL6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp21Q9QZL6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp21Q9QZL6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp21Q9QZL6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp21Q9QZL6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp21Q9QZL6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Usp21Q9QZL6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp21Q9QZL6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp21Q9QZL6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp21Q9QZL6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp21Q9QZL6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp21Q9QZL6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp21Q9QZL6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp21Q9QZL6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp21Q9QZL6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp21Q9QZL6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp21Q9QZL6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp21Q9QZL6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp21Q9QZL6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp21Q9QZL6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp21Q9QZL6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Usp21Q9QZL6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp21Q9QZL6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp21Q9QZL6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp21Q9QZL6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Usp21Q9QZL6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp21Q9QZL6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp21Q9QZL6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp21Q9QZL6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Usp21Q9QZL6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp21Q9QZL6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp21Q9QZL6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp21Q9QZL6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp21Q9QZL6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp21Q9QZL6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp21Q9QZL6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Usp21Q9QZL6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp21Q9QZL6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp21Q9QZL6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Usp21Q9QZL6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp21Q9QZL6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp21Q9QZL6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp21Q9QZL6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp21Q9QZL6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp21Q9QZL6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp21Q9QZL6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp21Q9QZL6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp21Q9QZL6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Usp21Q9QZL6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp21Q9QZL6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp21Q9QZL6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp21Q9QZL6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp21Q9QZL6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp21Q9QZL6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp21Q9QZL6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp21Q9QZL6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp21Q9QZL6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp21Q9QZL6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp21Q9QZL6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp21Q9QZL6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp21Q9QZL6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.1 ms