Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK97

Kcnq4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnq4Q9JK97 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnq4Q9JK97 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnq4Q9JK97 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnq4Q9JK97 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnq4Q9JK97 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnq4Q9JK97 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnq4Q9JK97 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnq4Q9JK97 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnq4Q9JK97 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnq4Q9JK97 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnq4Q9JK97 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnq4Q9JK97 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnq4Q9JK97 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnq4Q9JK97 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Kcnq4Q9JK97 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnq4Q9JK97 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnq4Q9JK97 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnq4Q9JK97 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnq4Q9JK97 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnq4Q9JK97 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnq4Q9JK97 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnq4Q9JK97 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnq4Q9JK97 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnq4Q9JK97 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnq4Q9JK97 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnq4Q9JK97 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnq4Q9JK97 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnq4Q9JK97 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnq4Q9JK97 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnq4Q9JK97 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnq4Q9JK97 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnq4Q9JK97 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnq4Q9JK97 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnq4Q9JK97 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnq4Q9JK97 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnq4Q9JK97 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnq4Q9JK97 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnq4Q9JK97 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnq4Q9JK97 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnq4Q9JK97 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnq4Q9JK97 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnq4Q9JK97 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnq4Q9JK97 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnq4Q9JK97 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnq4Q9JK97 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnq4Q9JK97 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnq4Q9JK97 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnq4Q9JK97 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnq4Q9JK97 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnq4Q9JK97 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnq4Q9JK97 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnq4Q9JK97 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kcnq4Q9JK97 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnq4Q9JK97 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnq4Q9JK97 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnq4Q9JK97 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnq4Q9JK97 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnq4Q9JK97 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnq4Q9JK97 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnq4Q9JK97 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnq4Q9JK97 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnq4Q9JK97 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnq4Q9JK97 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnq4Q9JK97 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnq4Q9JK97 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnq4Q9JK97 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnq4Q9JK97 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnq4Q9JK97 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnq4Q9JK97 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnq4Q9JK97 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnq4Q9JK97 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnq4Q9JK97 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnq4Q9JK97 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms