Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI4

Slc13a1, Solute carrier family 13 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc13a1Q9JHI4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc13a1Q9JHI4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc13a1Q9JHI4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc13a1Q9JHI4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc13a1Q9JHI4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc13a1Q9JHI4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc13a1Q9JHI4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc13a1Q9JHI4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc13a1Q9JHI4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc13a1Q9JHI4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc13a1Q9JHI4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc13a1Q9JHI4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc13a1Q9JHI4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc13a1Q9JHI4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc13a1Q9JHI4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc13a1Q9JHI4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc13a1Q9JHI4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc13a1Q9JHI4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc13a1Q9JHI4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms