Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Irx6Q9ER75 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Irx6Q9ER75 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Irx6Q9ER75 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Irx6Q9ER75 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Irx6Q9ER75 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Irx6Q9ER75 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Irx6Q9ER75 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Irx6Q9ER75 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Irx6Q9ER75 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Irx6Q9ER75 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Irx6Q9ER75 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Irx6Q9ER75 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Irx6Q9ER75 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Irx6Q9ER75 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Irx6Q9ER75 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Irx6Q9ER75 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Irx6Q9ER75 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Irx6Q9ER75 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Irx6Q9ER75 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Irx6Q9ER75 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Irx6Q9ER75 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Irx6Q9ER75 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Irx6Q9ER75 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Irx6Q9ER75 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Irx6Q9ER75 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Irx6Q9ER75 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Irx6Q9ER75 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Irx6Q9ER75 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Irx6Q9ER75 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Irx6Q9ER75 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Irx6Q9ER75 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Irx6Q9ER75 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Irx6Q9ER75 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Irx6Q9ER75 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Irx6Q9ER75 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Irx6Q9ER75 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Irx6Q9ER75 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Irx6Q9ER75 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Irx6Q9ER75 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Irx6Q9ER75 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Irx6Q9ER75 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Irx6Q9ER75 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Irx6Q9ER75 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Irx6Q9ER75 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Irx6Q9ER75 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Irx6Q9ER75 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Irx6Q9ER75 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Irx6Q9ER75 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Irx6Q9ER75 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Irx6Q9ER75 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Irx6Q9ER75 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Irx6Q9ER75 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Irx6Q9ER75 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Irx6Q9ER75 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Irx6Q9ER75 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Irx6Q9ER75 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Irx6Q9ER75 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Irx6Q9ER75 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Irx6Q9ER75 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Irx6Q9ER75 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Irx6Q9ER75 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Irx6Q9ER75 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Irx6Q9ER75 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Irx6Q9ER75 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Irx6Q9ER75 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Irx6Q9ER75 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Irx6Q9ER75 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Irx6Q9ER75 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Irx6Q9ER75 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Irx6Q9ER75 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Irx6Q9ER75 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Irx6Q9ER75 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Irx6Q9ER75 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Irx6Q9ER75 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Irx6Q9ER75 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Irx6Q9ER75 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Irx6Q9ER75 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Irx6Q9ER75 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Irx6Q9ER75 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Irx6Q9ER75 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Irx6Q9ER75 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Irx6Q9ER75 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Irx6Q9ER75 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Irx6Q9ER75 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Irx6Q9ER75 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Irx6Q9ER75 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Irx6Q9ER75 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Irx6Q9ER75 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Irx6Q9ER75 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Irx6Q9ER75 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Irx6Q9ER75 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Irx6Q9ER75 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Irx6Q9ER75 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Irx6Q9ER75 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Irx6Q9ER75 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Irx6Q9ER75 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Irx6Q9ER75 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Irx6Q9ER75 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Irx6Q9ER75 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms