Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQP6

Arr3, Arrestin-C, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arr3Q9EQP6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arr3Q9EQP6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arr3Q9EQP6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arr3Q9EQP6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arr3Q9EQP6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Arr3Q9EQP6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arr3Q9EQP6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arr3Q9EQP6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arr3Q9EQP6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arr3Q9EQP6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arr3Q9EQP6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arr3Q9EQP6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arr3Q9EQP6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arr3Q9EQP6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arr3Q9EQP6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arr3Q9EQP6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arr3Q9EQP6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arr3Q9EQP6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arr3Q9EQP6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arr3Q9EQP6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arr3Q9EQP6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arr3Q9EQP6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arr3Q9EQP6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arr3Q9EQP6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arr3Q9EQP6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arr3Q9EQP6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arr3Q9EQP6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arr3Q9EQP6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Arr3Q9EQP6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arr3Q9EQP6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arr3Q9EQP6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arr3Q9EQP6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arr3Q9EQP6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arr3Q9EQP6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arr3Q9EQP6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arr3Q9EQP6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Arr3Q9EQP6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Arr3Q9EQP6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arr3Q9EQP6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arr3Q9EQP6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arr3Q9EQP6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arr3Q9EQP6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arr3Q9EQP6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arr3Q9EQP6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arr3Q9EQP6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arr3Q9EQP6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arr3Q9EQP6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arr3Q9EQP6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arr3Q9EQP6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arr3Q9EQP6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Arr3Q9EQP6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arr3Q9EQP6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Arr3Q9EQP6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arr3Q9EQP6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arr3Q9EQP6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arr3Q9EQP6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Arr3Q9EQP6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arr3Q9EQP6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arr3Q9EQP6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Arr3Q9EQP6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arr3Q9EQP6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arr3Q9EQP6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arr3Q9EQP6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arr3Q9EQP6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arr3Q9EQP6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Arr3Q9EQP6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arr3Q9EQP6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arr3Q9EQP6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Arr3Q9EQP6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arr3Q9EQP6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arr3Q9EQP6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Arr3Q9EQP6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arr3Q9EQP6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arr3Q9EQP6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arr3Q9EQP6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arr3Q9EQP6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arr3Q9EQP6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Arr3Q9EQP6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Arr3Q9EQP6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arr3Q9EQP6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Arr3Q9EQP6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Arr3Q9EQP6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arr3Q9EQP6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arr3Q9EQP6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arr3Q9EQP6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Arr3Q9EQP6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Arr3Q9EQP6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arr3Q9EQP6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arr3Q9EQP6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arr3Q9EQP6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arr3Q9EQP6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Arr3Q9EQP6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arr3Q9EQP6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arr3Q9EQP6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arr3Q9EQP6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arr3Q9EQP6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Arr3Q9EQP6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Arr3Q9EQP6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arr3Q9EQP6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arr3Q9EQP6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms