Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CrotQ9DC50 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CrotQ9DC50 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CrotQ9DC50 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CrotQ9DC50 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CrotQ9DC50 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CrotQ9DC50 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CrotQ9DC50 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CrotQ9DC50 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CrotQ9DC50 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CrotQ9DC50 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CrotQ9DC50 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CrotQ9DC50 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CrotQ9DC50 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CrotQ9DC50 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CrotQ9DC50 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CrotQ9DC50 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CrotQ9DC50 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CrotQ9DC50 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CrotQ9DC50 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CrotQ9DC50 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CrotQ9DC50 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CrotQ9DC50 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CrotQ9DC50 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CrotQ9DC50 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CrotQ9DC50 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CrotQ9DC50 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CrotQ9DC50 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CrotQ9DC50 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CrotQ9DC50 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.1 ms