Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hm13Q9D8V0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hm13Q9D8V0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hm13Q9D8V0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hm13Q9D8V0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hm13Q9D8V0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hm13Q9D8V0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hm13Q9D8V0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hm13Q9D8V0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hm13Q9D8V0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hm13Q9D8V0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hm13Q9D8V0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hm13Q9D8V0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hm13Q9D8V0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms