Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rasgef1cQ9D300 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rasgef1cQ9D300 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rasgef1cQ9D300 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rasgef1cQ9D300 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rasgef1cQ9D300 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rasgef1cQ9D300 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rasgef1cQ9D300 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rasgef1cQ9D300 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rasgef1cQ9D300 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rasgef1cQ9D300 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rasgef1cQ9D300 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rasgef1cQ9D300 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rasgef1cQ9D300 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rasgef1cQ9D300 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rasgef1cQ9D300 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rasgef1cQ9D300 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rasgef1cQ9D300 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rasgef1cQ9D300 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rasgef1cQ9D300 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rasgef1cQ9D300 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rasgef1cQ9D300 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rasgef1cQ9D300 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rasgef1cQ9D300 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rasgef1cQ9D300 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rasgef1cQ9D300 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rasgef1cQ9D300 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rasgef1cQ9D300 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rasgef1cQ9D300 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rasgef1cQ9D300 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rasgef1cQ9D300 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rasgef1cQ9D300 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rasgef1cQ9D300 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rasgef1cQ9D300 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rasgef1cQ9D300 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rasgef1cQ9D300 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rasgef1cQ9D300 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rasgef1cQ9D300 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rasgef1cQ9D300 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rasgef1cQ9D300 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rasgef1cQ9D300 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rasgef1cQ9D300 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms