Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY8

Rnaseh2a, Ribonuclease H2 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2aQ9CWY8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rnaseh2aQ9CWY8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rnaseh2aQ9CWY8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rnaseh2aQ9CWY8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rnaseh2aQ9CWY8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rnaseh2aQ9CWY8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rnaseh2aQ9CWY8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rnaseh2aQ9CWY8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rnaseh2aQ9CWY8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rnaseh2aQ9CWY8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rnaseh2aQ9CWY8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rnaseh2aQ9CWY8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rnaseh2aQ9CWY8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rnaseh2aQ9CWY8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rnaseh2aQ9CWY8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rnaseh2aQ9CWY8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rnaseh2aQ9CWY8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rnaseh2aQ9CWY8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rnaseh2aQ9CWY8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rnaseh2aQ9CWY8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rnaseh2aQ9CWY8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rnaseh2aQ9CWY8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rnaseh2aQ9CWY8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rnaseh2aQ9CWY8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Rnaseh2aQ9CWY8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rnaseh2aQ9CWY8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rnaseh2aQ9CWY8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rnaseh2aQ9CWY8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rnaseh2aQ9CWY8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rnaseh2aQ9CWY8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rnaseh2aQ9CWY8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rnaseh2aQ9CWY8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rnaseh2aQ9CWY8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rnaseh2aQ9CWY8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rnaseh2aQ9CWY8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rnaseh2aQ9CWY8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rnaseh2aQ9CWY8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rnaseh2aQ9CWY8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rnaseh2aQ9CWY8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rnaseh2aQ9CWY8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rnaseh2aQ9CWY8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rnaseh2aQ9CWY8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rnaseh2aQ9CWY8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rnaseh2aQ9CWY8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Rnaseh2aQ9CWY8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rnaseh2aQ9CWY8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rnaseh2aQ9CWY8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rnaseh2aQ9CWY8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rnaseh2aQ9CWY8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rnaseh2aQ9CWY8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Rnaseh2aQ9CWY8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnaseh2aQ9CWY8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnaseh2aQ9CWY8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rnaseh2aQ9CWY8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rnaseh2aQ9CWY8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rnaseh2aQ9CWY8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rnaseh2aQ9CWY8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnaseh2aQ9CWY8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rnaseh2aQ9CWY8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rnaseh2aQ9CWY8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rnaseh2aQ9CWY8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rnaseh2aQ9CWY8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rnaseh2aQ9CWY8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rnaseh2aQ9CWY8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rnaseh2aQ9CWY8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rnaseh2aQ9CWY8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rnaseh2aQ9CWY8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnaseh2aQ9CWY8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnaseh2aQ9CWY8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnaseh2aQ9CWY8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rnaseh2aQ9CWY8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rnaseh2aQ9CWY8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rnaseh2aQ9CWY8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rnaseh2aQ9CWY8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rnaseh2aQ9CWY8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Rnaseh2aQ9CWY8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Rnaseh2aQ9CWY8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rnaseh2aQ9CWY8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rnaseh2aQ9CWY8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rnaseh2aQ9CWY8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rnaseh2aQ9CWY8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rnaseh2aQ9CWY8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rnaseh2aQ9CWY8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rnaseh2aQ9CWY8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rnaseh2aQ9CWY8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rnaseh2aQ9CWY8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnaseh2aQ9CWY8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnaseh2aQ9CWY8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rnaseh2aQ9CWY8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rnaseh2aQ9CWY8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rnaseh2aQ9CWY8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Rnaseh2aQ9CWY8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rnaseh2aQ9CWY8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rnaseh2aQ9CWY8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rnaseh2aQ9CWY8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rnaseh2aQ9CWY8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rnaseh2aQ9CWY8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rnaseh2aQ9CWY8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rnaseh2aQ9CWY8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rnaseh2aQ9CWY8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms