Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA9

Fgfr1op2, FGFR1 oncogene partner 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1op2Q9CRA9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr1op2Q9CRA9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr1op2Q9CRA9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr1op2Q9CRA9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr1op2Q9CRA9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr1op2Q9CRA9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr1op2Q9CRA9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgfr1op2Q9CRA9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgfr1op2Q9CRA9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgfr1op2Q9CRA9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgfr1op2Q9CRA9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgfr1op2Q9CRA9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgfr1op2Q9CRA9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgfr1op2Q9CRA9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgfr1op2Q9CRA9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgfr1op2Q9CRA9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fgfr1op2Q9CRA9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fgfr1op2Q9CRA9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fgfr1op2Q9CRA9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fgfr1op2Q9CRA9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgfr1op2Q9CRA9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgfr1op2Q9CRA9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgfr1op2Q9CRA9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgfr1op2Q9CRA9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgfr1op2Q9CRA9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgfr1op2Q9CRA9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgfr1op2Q9CRA9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgfr1op2Q9CRA9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgfr1op2Q9CRA9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgfr1op2Q9CRA9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgfr1op2Q9CRA9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgfr1op2Q9CRA9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgfr1op2Q9CRA9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgfr1op2Q9CRA9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgfr1op2Q9CRA9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgfr1op2Q9CRA9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgfr1op2Q9CRA9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgfr1op2Q9CRA9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms