Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR36

Gkn1, Gastrokine-1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn1Q9CR36 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gkn1Q9CR36 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gkn1Q9CR36 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gkn1Q9CR36 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gkn1Q9CR36 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gkn1Q9CR36 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gkn1Q9CR36 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gkn1Q9CR36 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gkn1Q9CR36 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gkn1Q9CR36 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gkn1Q9CR36 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gkn1Q9CR36 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gkn1Q9CR36 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gkn1Q9CR36 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gkn1Q9CR36 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gkn1Q9CR36 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gkn1Q9CR36 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms