Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB5

Gsdmc, Gasdermin-C, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GsdmcQ99NB5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GsdmcQ99NB5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GsdmcQ99NB5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GsdmcQ99NB5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GsdmcQ99NB5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GsdmcQ99NB5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GsdmcQ99NB5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GsdmcQ99NB5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GsdmcQ99NB5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GsdmcQ99NB5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GsdmcQ99NB5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GsdmcQ99NB5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GsdmcQ99NB5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GsdmcQ99NB5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GsdmcQ99NB5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GsdmcQ99NB5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GsdmcQ99NB5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmcQ99NB5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmcQ99NB5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmcQ99NB5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GsdmcQ99NB5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GsdmcQ99NB5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GsdmcQ99NB5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GsdmcQ99NB5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GsdmcQ99NB5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GsdmcQ99NB5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GsdmcQ99NB5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GsdmcQ99NB5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GsdmcQ99NB5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GsdmcQ99NB5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GsdmcQ99NB5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GsdmcQ99NB5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GsdmcQ99NB5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GsdmcQ99NB5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GsdmcQ99NB5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GsdmcQ99NB5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GsdmcQ99NB5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GsdmcQ99NB5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GsdmcQ99NB5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GsdmcQ99NB5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GsdmcQ99NB5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GsdmcQ99NB5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GsdmcQ99NB5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GsdmcQ99NB5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GsdmcQ99NB5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GsdmcQ99NB5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GsdmcQ99NB5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GsdmcQ99NB5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GsdmcQ99NB5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GsdmcQ99NB5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GsdmcQ99NB5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GsdmcQ99NB5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms