Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SptssbQ925E8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SptssbQ925E8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SptssbQ925E8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SptssbQ925E8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SptssbQ925E8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SptssbQ925E8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SptssbQ925E8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SptssbQ925E8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms