Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snx4Q91YJ2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx4Q91YJ2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx4Q91YJ2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx4Q91YJ2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx4Q91YJ2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx4Q91YJ2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx4Q91YJ2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx4Q91YJ2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx4Q91YJ2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx4Q91YJ2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx4Q91YJ2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx4Q91YJ2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx4Q91YJ2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx4Q91YJ2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx4Q91YJ2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx4Q91YJ2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx4Q91YJ2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx4Q91YJ2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx4Q91YJ2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx4Q91YJ2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx4Q91YJ2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx4Q91YJ2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx4Q91YJ2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx4Q91YJ2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx4Q91YJ2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx4Q91YJ2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx4Q91YJ2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx4Q91YJ2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snx4Q91YJ2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx4Q91YJ2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snx4Q91YJ2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snx4Q91YJ2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snx4Q91YJ2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snx4Q91YJ2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx4Q91YJ2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx4Q91YJ2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx4Q91YJ2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx4Q91YJ2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx4Q91YJ2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx4Q91YJ2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx4Q91YJ2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx4Q91YJ2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx4Q91YJ2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms