Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y13

Pcdha7, Protocadherin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha7Q91Y13 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdha7Q91Y13 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdha7Q91Y13 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdha7Q91Y13 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdha7Q91Y13 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdha7Q91Y13 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdha7Q91Y13 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdha7Q91Y13 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcdha7Q91Y13 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcdha7Q91Y13 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcdha7Q91Y13 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcdha7Q91Y13 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pcdha7Q91Y13 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pcdha7Q91Y13 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pcdha7Q91Y13 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdha7Q91Y13 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdha7Q91Y13 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdha7Q91Y13 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdha7Q91Y13 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdha7Q91Y13 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdha7Q91Y13 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdha7Q91Y13 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdha7Q91Y13 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdha7Q91Y13 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdha7Q91Y13 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdha7Q91Y13 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdha7Q91Y13 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdha7Q91Y13 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdha7Q91Y13 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcdha7Q91Y13 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcdha7Q91Y13 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcdha7Q91Y13 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcdha7Q91Y13 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcdha7Q91Y13 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcdha7Q91Y13 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcdha7Q91Y13 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdha7Q91Y13 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdha7Q91Y13 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pcdha7Q91Y13 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pcdha7Q91Y13 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdha7Q91Y13 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdha7Q91Y13 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdha7Q91Y13 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdha7Q91Y13 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdha7Q91Y13 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdha7Q91Y13 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdha7Q91Y13 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdha7Q91Y13 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdha7Q91Y13 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdha7Q91Y13 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdha7Q91Y13 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdha7Q91Y13 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdha7Q91Y13 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdha7Q91Y13 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdha7Q91Y13 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdha7Q91Y13 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdha7Q91Y13 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdha7Q91Y13 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdha7Q91Y13 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdha7Q91Y13 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdha7Q91Y13 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcdha7Q91Y13 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcdha7Q91Y13 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdha7Q91Y13 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdha7Q91Y13 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdha7Q91Y13 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdha7Q91Y13 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdha7Q91Y13 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcdha7Q91Y13 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcdha7Q91Y13 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcdha7Q91Y13 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcdha7Q91Y13 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcdha7Q91Y13 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcdha7Q91Y13 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcdha7Q91Y13 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcdha7Q91Y13 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcdha7Q91Y13 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcdha7Q91Y13 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcdha7Q91Y13 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcdha7Q91Y13 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdha7Q91Y13 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdha7Q91Y13 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdha7Q91Y13 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdha7Q91Y13 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdha7Q91Y13 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pcdha7Q91Y13 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pcdha7Q91Y13 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcdha7Q91Y13 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms