Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lrit1Q8K099 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lrit1Q8K099 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lrit1Q8K099 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lrit1Q8K099 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lrit1Q8K099 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lrit1Q8K099 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lrit1Q8K099 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Lrit1Q8K099 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Lrit1Q8K099 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Lrit1Q8K099 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lrit1Q8K099 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Lrit1Q8K099 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Lrit1Q8K099 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Lrit1Q8K099 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Lrit1Q8K099 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lrit1Q8K099 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lrit1Q8K099 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Lrit1Q8K099 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Lrit1Q8K099 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lrit1Q8K099 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lrit1Q8K099 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lrit1Q8K099 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lrit1Q8K099 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lrit1Q8K099 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lrit1Q8K099 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lrit1Q8K099 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Lrit1Q8K099 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lrit1Q8K099 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lrit1Q8K099 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lrit1Q8K099 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lrit1Q8K099 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lrit1Q8K099 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lrit1Q8K099 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Lrit1Q8K099 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lrit1Q8K099 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lrit1Q8K099 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lrit1Q8K099 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lrit1Q8K099 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lrit1Q8K099 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Lrit1Q8K099 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lrit1Q8K099 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lrit1Q8K099 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Lrit1Q8K099 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Lrit1Q8K099 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lrit1Q8K099 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lrit1Q8K099 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lrit1Q8K099 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Lrit1Q8K099 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lrit1Q8K099 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lrit1Q8K099 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lrit1Q8K099 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lrit1Q8K099 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Lrit1Q8K099 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lrit1Q8K099 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lrit1Q8K099 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lrit1Q8K099 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lrit1Q8K099 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Lrit1Q8K099 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lrit1Q8K099 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lrit1Q8K099 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Lrit1Q8K099 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Lrit1Q8K099 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Lrit1Q8K099 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lrit1Q8K099 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lrit1Q8K099 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lrit1Q8K099 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lrit1Q8K099 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Lrit1Q8K099 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lrit1Q8K099 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lrit1Q8K099 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lrit1Q8K099 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrit1Q8K099 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrit1Q8K099 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrit1Q8K099 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrit1Q8K099 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrit1Q8K099 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Lrit1Q8K099 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lrit1Q8K099 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lrit1Q8K099 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lrit1Q8K099 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lrit1Q8K099 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Lrit1Q8K099 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Lrit1Q8K099 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrit1Q8K099 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lrit1Q8K099 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lrit1Q8K099 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lrit1Q8K099 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lrit1Q8K099 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lrit1Q8K099 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lrit1Q8K099 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lrit1Q8K099 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lrit1Q8K099 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrit1Q8K099 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrit1Q8K099 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrit1Q8K099 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrit1Q8K099 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lrit1Q8K099 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lrit1Q8K099 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lrit1Q8K099 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms