Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJF9

Ago3, Protein argonaute-3, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ago3Q8CJF9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ago3Q8CJF9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ago3Q8CJF9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ago3Q8CJF9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ago3Q8CJF9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ago3Q8CJF9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ago3Q8CJF9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ago3Q8CJF9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ago3Q8CJF9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ago3Q8CJF9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ago3Q8CJF9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ago3Q8CJF9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ago3Q8CJF9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ago3Q8CJF9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ago3Q8CJF9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ago3Q8CJF9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ago3Q8CJF9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ago3Q8CJF9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ago3Q8CJF9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ago3Q8CJF9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ago3Q8CJF9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ago3Q8CJF9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ago3Q8CJF9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ago3Q8CJF9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ago3Q8CJF9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ago3Q8CJF9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ago3Q8CJF9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ago3Q8CJF9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ago3Q8CJF9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ago3Q8CJF9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ago3Q8CJF9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ago3Q8CJF9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ago3Q8CJF9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ago3Q8CJF9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ago3Q8CJF9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ago3Q8CJF9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ago3Q8CJF9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ago3Q8CJF9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ago3Q8CJF9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ago3Q8CJF9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ago3Q8CJF9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ago3Q8CJF9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ago3Q8CJF9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ago3Q8CJF9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ago3Q8CJF9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ago3Q8CJF9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ago3Q8CJF9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ago3Q8CJF9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ago3Q8CJF9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ago3Q8CJF9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ago3Q8CJF9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ago3Q8CJF9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ago3Q8CJF9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ago3Q8CJF9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ago3Q8CJF9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ago3Q8CJF9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ago3Q8CJF9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ago3Q8CJF9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ago3Q8CJF9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ago3Q8CJF9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ago3Q8CJF9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ago3Q8CJF9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ago3Q8CJF9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ago3Q8CJF9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ago3Q8CJF9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ago3Q8CJF9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ago3Q8CJF9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ago3Q8CJF9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ago3Q8CJF9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ago3Q8CJF9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ago3Q8CJF9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ago3Q8CJF9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ago3Q8CJF9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ago3Q8CJF9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ago3Q8CJF9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ago3Q8CJF9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ago3Q8CJF9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ago3Q8CJF9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ago3Q8CJF9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ago3Q8CJF9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ago3Q8CJF9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ago3Q8CJF9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ago3Q8CJF9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ago3Q8CJF9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ago3Q8CJF9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ago3Q8CJF9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ago3Q8CJF9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ago3Q8CJF9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ago3Q8CJF9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ago3Q8CJF9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ago3Q8CJF9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ago3Q8CJF9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ago3Q8CJF9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ago3Q8CJF9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ago3Q8CJF9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ago3Q8CJF9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ago3Q8CJF9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ago3Q8CJF9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ago3Q8CJF9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ago3Q8CJF9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms