Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7R7

Rfx6, DNA-binding protein RFX6, mousemouse

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Length 927 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx6Q8C7R7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rfx6Q8C7R7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx6Q8C7R7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rfx6Q8C7R7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx6Q8C7R7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx6Q8C7R7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx6Q8C7R7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rfx6Q8C7R7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx6Q8C7R7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx6Q8C7R7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rfx6Q8C7R7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx6Q8C7R7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx6Q8C7R7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx6Q8C7R7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx6Q8C7R7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx6Q8C7R7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx6Q8C7R7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx6Q8C7R7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rfx6Q8C7R7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfx6Q8C7R7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfx6Q8C7R7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rfx6Q8C7R7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx6Q8C7R7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx6Q8C7R7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx6Q8C7R7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rfx6Q8C7R7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfx6Q8C7R7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfx6Q8C7R7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfx6Q8C7R7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rfx6Q8C7R7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx6Q8C7R7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx6Q8C7R7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx6Q8C7R7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx6Q8C7R7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rfx6Q8C7R7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx6Q8C7R7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rfx6Q8C7R7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx6Q8C7R7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx6Q8C7R7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx6Q8C7R7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx6Q8C7R7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx6Q8C7R7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rfx6Q8C7R7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx6Q8C7R7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx6Q8C7R7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx6Q8C7R7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx6Q8C7R7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx6Q8C7R7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx6Q8C7R7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx6Q8C7R7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx6Q8C7R7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfx6Q8C7R7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx6Q8C7R7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx6Q8C7R7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx6Q8C7R7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx6Q8C7R7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx6Q8C7R7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx6Q8C7R7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx6Q8C7R7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx6Q8C7R7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx6Q8C7R7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx6Q8C7R7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx6Q8C7R7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx6Q8C7R7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx6Q8C7R7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx6Q8C7R7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx6Q8C7R7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx6Q8C7R7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx6Q8C7R7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx6Q8C7R7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx6Q8C7R7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx6Q8C7R7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx6Q8C7R7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx6Q8C7R7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx6Q8C7R7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx6Q8C7R7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx6Q8C7R7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfx6Q8C7R7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rfx6Q8C7R7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx6Q8C7R7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx6Q8C7R7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx6Q8C7R7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx6Q8C7R7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx6Q8C7R7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx6Q8C7R7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx6Q8C7R7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx6Q8C7R7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx6Q8C7R7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx6Q8C7R7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx6Q8C7R7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx6Q8C7R7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx6Q8C7R7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx6Q8C7R7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx6Q8C7R7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx6Q8C7R7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx6Q8C7R7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx6Q8C7R7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx6Q8C7R7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx6Q8C7R7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx6Q8C7R7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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