Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
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4933409G03RikQ8C5U0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
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4933409G03RikQ8C5U0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
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4933409G03RikQ8C5U0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
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4933409G03RikQ8C5U0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
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4933409G03RikQ8C5U0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
4933409G03RikQ8C5U0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
4933409G03RikQ8C5U0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
4933409G03RikQ8C5U0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933409G03RikQ8C5U0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4933409G03RikQ8C5U0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4933409G03RikQ8C5U0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4933409G03RikQ8C5U0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
4933409G03RikQ8C5U0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4933409G03RikQ8C5U0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
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4933409G03RikQ8C5U0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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4933409G03RikQ8C5U0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4933409G03RikQ8C5U0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4933409G03RikQ8C5U0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4933409G03RikQ8C5U0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4933409G03RikQ8C5U0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4933409G03RikQ8C5U0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4933409G03RikQ8C5U0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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4933409G03RikQ8C5U0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4933409G03RikQ8C5U0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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4933409G03RikQ8C5U0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
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4933409G03RikQ8C5U0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
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4933409G03RikQ8C5U0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
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4933409G03RikQ8C5U0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
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4933409G03RikQ8C5U0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
4933409G03RikQ8C5U0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4933409G03RikQ8C5U0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4933409G03RikQ8C5U0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
4933409G03RikQ8C5U0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4933409G03RikQ8C5U0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4933409G03RikQ8C5U0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
4933409G03RikQ8C5U0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
4933409G03RikQ8C5U0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4933409G03RikQ8C5U0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4933409G03RikQ8C5U0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
4933409G03RikQ8C5U0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4933409G03RikQ8C5U0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
4933409G03RikQ8C5U0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4933409G03RikQ8C5U0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4933409G03RikQ8C5U0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4933409G03RikQ8C5U0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
4933409G03RikQ8C5U0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4933409G03RikQ8C5U0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
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