Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ube3dQ8BX13 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube3dQ8BX13 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube3dQ8BX13 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube3dQ8BX13 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube3dQ8BX13 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ube3dQ8BX13 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube3dQ8BX13 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube3dQ8BX13 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ube3dQ8BX13 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube3dQ8BX13 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ube3dQ8BX13 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube3dQ8BX13 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ube3dQ8BX13 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube3dQ8BX13 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube3dQ8BX13 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube3dQ8BX13 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube3dQ8BX13 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ube3dQ8BX13 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube3dQ8BX13 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube3dQ8BX13 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube3dQ8BX13 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube3dQ8BX13 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube3dQ8BX13 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube3dQ8BX13 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube3dQ8BX13 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube3dQ8BX13 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube3dQ8BX13 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ube3dQ8BX13 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ube3dQ8BX13 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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