Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vipas39Q8BGQ1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Vipas39Q8BGQ1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vipas39Q8BGQ1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vipas39Q8BGQ1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vipas39Q8BGQ1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vipas39Q8BGQ1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vipas39Q8BGQ1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vipas39Q8BGQ1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vipas39Q8BGQ1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vipas39Q8BGQ1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Vipas39Q8BGQ1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vipas39Q8BGQ1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vipas39Q8BGQ1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vipas39Q8BGQ1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vipas39Q8BGQ1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vipas39Q8BGQ1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vipas39Q8BGQ1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vipas39Q8BGQ1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vipas39Q8BGQ1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vipas39Q8BGQ1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vipas39Q8BGQ1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vipas39Q8BGQ1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vipas39Q8BGQ1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vipas39Q8BGQ1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Vipas39Q8BGQ1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vipas39Q8BGQ1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vipas39Q8BGQ1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vipas39Q8BGQ1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vipas39Q8BGQ1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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