Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrsam1Q80ZI6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrsam1Q80ZI6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrsam1Q80ZI6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrsam1Q80ZI6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrsam1Q80ZI6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrsam1Q80ZI6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrsam1Q80ZI6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrsam1Q80ZI6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrsam1Q80ZI6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrsam1Q80ZI6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrsam1Q80ZI6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrsam1Q80ZI6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrsam1Q80ZI6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrsam1Q80ZI6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrsam1Q80ZI6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrsam1Q80ZI6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms