Protein–RNA interactions for Protein: Q80TZ3

Dnajc6, Putative tyrosine-protein phosphatase auxilin, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc6Q80TZ3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnajc6Q80TZ3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnajc6Q80TZ3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dnajc6Q80TZ3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnajc6Q80TZ3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnajc6Q80TZ3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnajc6Q80TZ3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms