Protein–RNA interactions for Protein: Q80TV8

Clasp1, CLIP-associating protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clasp1Q80TV8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Clasp1Q80TV8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC35,47■■■■□ 3,27
Clasp1Q80TV8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC35,47■■■■□ 3,27
Clasp1Q80TV8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Clasp1Q80TV8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Clasp1Q80TV8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,45■■■■□ 3,27
Clasp1Q80TV8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Clasp1Q80TV8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC35,45■■■■□ 3,27
Clasp1Q80TV8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC35,44■■■■□ 3,26
Clasp1Q80TV8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Clasp1Q80TV8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC35,44■■■■□ 3,26
Clasp1Q80TV8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Clasp1Q80TV8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Clasp1Q80TV8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Clasp1Q80TV8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Clasp1Q80TV8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Clasp1Q80TV8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
Clasp1Q80TV8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
Clasp1Q80TV8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Clasp1Q80TV8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Clasp1Q80TV8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC35,41■■■■□ 3,26
Clasp1Q80TV8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Clasp1Q80TV8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,39■■■■□ 3,26
Clasp1Q80TV8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
Clasp1Q80TV8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
Clasp1Q80TV8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35,39■■■■□ 3,26
Clasp1Q80TV8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Clasp1Q80TV8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC35,38■■■■□ 3,25
Clasp1Q80TV8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Clasp1Q80TV8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Clasp1Q80TV8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Clasp1Q80TV8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35,38■■■■□ 3,25
Clasp1Q80TV8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC35,37■■■■□ 3,25
Clasp1Q80TV8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35,37■■■■□ 3,25
Clasp1Q80TV8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC35,35■■■■□ 3,25
Clasp1Q80TV8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Clasp1Q80TV8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35,34■■■■□ 3,25
Clasp1Q80TV8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Clasp1Q80TV8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC35,33■■■■□ 3,25
Clasp1Q80TV8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC35,33■■■■□ 3,25
Clasp1Q80TV8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,33■■■■□ 3,25
Clasp1Q80TV8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Clasp1Q80TV8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35,31■■■■□ 3,24
Clasp1Q80TV8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Clasp1Q80TV8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC35,31■■■■□ 3,24
Clasp1Q80TV8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Clasp1Q80TV8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Clasp1Q80TV8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,3■■■■□ 3,24
Clasp1Q80TV8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Clasp1Q80TV8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,29■■■■□ 3,24
Clasp1Q80TV8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Clasp1Q80TV8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC35,29■■■■□ 3,24
Clasp1Q80TV8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,28■■■■□ 3,24
Clasp1Q80TV8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
Clasp1Q80TV8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
Clasp1Q80TV8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,23
Clasp1Q80TV8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,26■■■■□ 3,23
Clasp1Q80TV8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
Clasp1Q80TV8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,23■■■■□ 3,23
Clasp1Q80TV8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,22■■■■□ 3,23
Clasp1Q80TV8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC35,22■■■■□ 3,23
Clasp1Q80TV8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC35,21■■■■□ 3,23
Clasp1Q80TV8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC35,21■■■■□ 3,23
Clasp1Q80TV8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,21■■■■□ 3,23
Clasp1Q80TV8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Clasp1Q80TV8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC35,2■■■■□ 3,22
Clasp1Q80TV8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35,16■■■■□ 3,22
Clasp1Q80TV8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Clasp1Q80TV8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC35,15■■■■□ 3,22
Clasp1Q80TV8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Clasp1Q80TV8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Clasp1Q80TV8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,13■■■■□ 3,22
Clasp1Q80TV8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,22
Clasp1Q80TV8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Clasp1Q80TV8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Clasp1Q80TV8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Clasp1Q80TV8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Clasp1Q80TV8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Clasp1Q80TV8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Clasp1Q80TV8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC35,1■■■■□ 3,21
Clasp1Q80TV8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Clasp1Q80TV8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,09■■■■□ 3,21
Clasp1Q80TV8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Clasp1Q80TV8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Clasp1Q80TV8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC35,08■■■■□ 3,21
Clasp1Q80TV8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Clasp1Q80TV8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Clasp1Q80TV8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Clasp1Q80TV8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Clasp1Q80TV8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC35,05■■■■□ 3,2
Clasp1Q80TV8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC35,05■■■■□ 3,2
Clasp1Q80TV8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Clasp1Q80TV8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,04■■■■□ 3,2
Clasp1Q80TV8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Clasp1Q80TV8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Clasp1Q80TV8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Clasp1Q80TV8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35,03■■■■□ 3,2
Clasp1Q80TV8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,03■■■■□ 3,2
Clasp1Q80TV8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,02■■■■□ 3,2
Clasp1Q80TV8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC35,01■■■■□ 3,19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,5 ms