Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lamp3Q7TST5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lamp3Q7TST5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lamp3Q7TST5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lamp3Q7TST5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms