Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctdp1Q7TSG2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctdp1Q7TSG2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ctdp1Q7TSG2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctdp1Q7TSG2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms