Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
ScocQ78YZ6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
ScocQ78YZ6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
ScocQ78YZ6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
ScocQ78YZ6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
ScocQ78YZ6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
ScocQ78YZ6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,57■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20,57■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,55■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,55■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,55■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,54■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,54■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,53■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,53■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,52■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,52■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
ScocQ78YZ6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20,51■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20,51■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20,5■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20,5■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,5■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,49■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20,49■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20,49■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20,48■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,48■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,47■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20,47■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,47■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,46■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20,46■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20,46■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
ScocQ78YZ6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,45■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20,45■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,44■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20,44■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
ScocQ78YZ6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,43■□□□□ 0,86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,2 ms