Protein–RNA interactions for Protein: Q78PG9

Ccdc25, Coiled-coil domain-containing protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc25Q78PG9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc25Q78PG9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc25Q78PG9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc25Q78PG9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc25Q78PG9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc25Q78PG9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc25Q78PG9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc25Q78PG9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc25Q78PG9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc25Q78PG9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc25Q78PG9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc25Q78PG9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc25Q78PG9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc25Q78PG9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc25Q78PG9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc25Q78PG9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc25Q78PG9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc25Q78PG9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc25Q78PG9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc25Q78PG9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc25Q78PG9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc25Q78PG9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc25Q78PG9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc25Q78PG9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc25Q78PG9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc25Q78PG9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc25Q78PG9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc25Q78PG9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc25Q78PG9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.9 ms