Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tfap2eQ6VUP9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tfap2eQ6VUP9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tfap2eQ6VUP9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tfap2eQ6VUP9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tfap2eQ6VUP9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tfap2eQ6VUP9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tfap2eQ6VUP9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tfap2eQ6VUP9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tfap2eQ6VUP9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Tfap2eQ6VUP9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tfap2eQ6VUP9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tfap2eQ6VUP9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tfap2eQ6VUP9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tfap2eQ6VUP9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tfap2eQ6VUP9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tfap2eQ6VUP9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tfap2eQ6VUP9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tfap2eQ6VUP9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tfap2eQ6VUP9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tfap2eQ6VUP9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tfap2eQ6VUP9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tfap2eQ6VUP9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tfap2eQ6VUP9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tfap2eQ6VUP9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tfap2eQ6VUP9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tfap2eQ6VUP9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tfap2eQ6VUP9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms