Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Gapvd1Q6PAR5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Gapvd1Q6PAR5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Gapvd1Q6PAR5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Gapvd1Q6PAR5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Gapvd1Q6PAR5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Gapvd1Q6PAR5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Gapvd1Q6PAR5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Gapvd1Q6PAR5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Gapvd1Q6PAR5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Gapvd1Q6PAR5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Gapvd1Q6PAR5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Gapvd1Q6PAR5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Gapvd1Q6PAR5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Gapvd1Q6PAR5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Gapvd1Q6PAR5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Gapvd1Q6PAR5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Gapvd1Q6PAR5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Gapvd1Q6PAR5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Gapvd1Q6PAR5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Gapvd1Q6PAR5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Gapvd1Q6PAR5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Gapvd1Q6PAR5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Gapvd1Q6PAR5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Gapvd1Q6PAR5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Gapvd1Q6PAR5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Gapvd1Q6PAR5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Gapvd1Q6PAR5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Gapvd1Q6PAR5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Gapvd1Q6PAR5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Gapvd1Q6PAR5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Gapvd1Q6PAR5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Gapvd1Q6PAR5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Gapvd1Q6PAR5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Gapvd1Q6PAR5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Gapvd1Q6PAR5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Gapvd1Q6PAR5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Gapvd1Q6PAR5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Gapvd1Q6PAR5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Gapvd1Q6PAR5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Gapvd1Q6PAR5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Gapvd1Q6PAR5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Gapvd1Q6PAR5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Gapvd1Q6PAR5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Gapvd1Q6PAR5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Gapvd1Q6PAR5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Gapvd1Q6PAR5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Gapvd1Q6PAR5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Gapvd1Q6PAR5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Gapvd1Q6PAR5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Gapvd1Q6PAR5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Gapvd1Q6PAR5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Gapvd1Q6PAR5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Gapvd1Q6PAR5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Gapvd1Q6PAR5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Gapvd1Q6PAR5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Gapvd1Q6PAR5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Gapvd1Q6PAR5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Gapvd1Q6PAR5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Gapvd1Q6PAR5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Gapvd1Q6PAR5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Gapvd1Q6PAR5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Gapvd1Q6PAR5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Gapvd1Q6PAR5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Gapvd1Q6PAR5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Gapvd1Q6PAR5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Gapvd1Q6PAR5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Gapvd1Q6PAR5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Gapvd1Q6PAR5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Gapvd1Q6PAR5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Gapvd1Q6PAR5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Gapvd1Q6PAR5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Gapvd1Q6PAR5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Gapvd1Q6PAR5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Gapvd1Q6PAR5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Gapvd1Q6PAR5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Gapvd1Q6PAR5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Gapvd1Q6PAR5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Gapvd1Q6PAR5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Gapvd1Q6PAR5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Gapvd1Q6PAR5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Gapvd1Q6PAR5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Gapvd1Q6PAR5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Gapvd1Q6PAR5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Gapvd1Q6PAR5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Gapvd1Q6PAR5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Gapvd1Q6PAR5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Gapvd1Q6PAR5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Gapvd1Q6PAR5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Gapvd1Q6PAR5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Gapvd1Q6PAR5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Gapvd1Q6PAR5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Gapvd1Q6PAR5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Gapvd1Q6PAR5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Gapvd1Q6PAR5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Gapvd1Q6PAR5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Gapvd1Q6PAR5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Gapvd1Q6PAR5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Gapvd1Q6PAR5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms