Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H2

Nes, Nestin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NesQ6P5H2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NesQ6P5H2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NesQ6P5H2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NesQ6P5H2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NesQ6P5H2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NesQ6P5H2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NesQ6P5H2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NesQ6P5H2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NesQ6P5H2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NesQ6P5H2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NesQ6P5H2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NesQ6P5H2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NesQ6P5H2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NesQ6P5H2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NesQ6P5H2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NesQ6P5H2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NesQ6P5H2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NesQ6P5H2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NesQ6P5H2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NesQ6P5H2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NesQ6P5H2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NesQ6P5H2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NesQ6P5H2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NesQ6P5H2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NesQ6P5H2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NesQ6P5H2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NesQ6P5H2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NesQ6P5H2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NesQ6P5H2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NesQ6P5H2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NesQ6P5H2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NesQ6P5H2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NesQ6P5H2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NesQ6P5H2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NesQ6P5H2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NesQ6P5H2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NesQ6P5H2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NesQ6P5H2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NesQ6P5H2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NesQ6P5H2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NesQ6P5H2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NesQ6P5H2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NesQ6P5H2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NesQ6P5H2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NesQ6P5H2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NesQ6P5H2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NesQ6P5H2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NesQ6P5H2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NesQ6P5H2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NesQ6P5H2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NesQ6P5H2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NesQ6P5H2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NesQ6P5H2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NesQ6P5H2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NesQ6P5H2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NesQ6P5H2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NesQ6P5H2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
NesQ6P5H2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NesQ6P5H2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NesQ6P5H2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NesQ6P5H2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NesQ6P5H2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NesQ6P5H2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NesQ6P5H2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NesQ6P5H2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NesQ6P5H2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NesQ6P5H2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NesQ6P5H2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NesQ6P5H2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NesQ6P5H2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NesQ6P5H2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NesQ6P5H2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NesQ6P5H2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NesQ6P5H2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms