Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q6DFW0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q6DFW0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q6DFW0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q6DFW0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q6DFW0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Q6DFW0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q6DFW0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q6DFW0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q6DFW0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q6DFW0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q6DFW0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q6DFW0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q6DFW0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q6DFW0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q6DFW0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q6DFW0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q6DFW0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q6DFW0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q6DFW0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q6DFW0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q6DFW0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q6DFW0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q6DFW0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q6DFW0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q6DFW0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q6DFW0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q6DFW0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q6DFW0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q6DFW0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q6DFW0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q6DFW0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q6DFW0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q6DFW0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q6DFW0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
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