Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ino80dQ66JY2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ino80dQ66JY2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ino80dQ66JY2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ino80dQ66JY2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ino80dQ66JY2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ino80dQ66JY2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ino80dQ66JY2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ino80dQ66JY2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ino80dQ66JY2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ino80dQ66JY2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ino80dQ66JY2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ino80dQ66JY2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ino80dQ66JY2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ino80dQ66JY2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ino80dQ66JY2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ino80dQ66JY2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ino80dQ66JY2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ino80dQ66JY2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ino80dQ66JY2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ino80dQ66JY2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ino80dQ66JY2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ino80dQ66JY2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ino80dQ66JY2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ino80dQ66JY2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ino80dQ66JY2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ino80dQ66JY2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ino80dQ66JY2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ino80dQ66JY2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ino80dQ66JY2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ino80dQ66JY2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ino80dQ66JY2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ino80dQ66JY2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ino80dQ66JY2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ino80dQ66JY2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80dQ66JY2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80dQ66JY2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80dQ66JY2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80dQ66JY2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ino80dQ66JY2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ino80dQ66JY2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ino80dQ66JY2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ino80dQ66JY2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80dQ66JY2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80dQ66JY2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80dQ66JY2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80dQ66JY2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80dQ66JY2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ino80dQ66JY2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ino80dQ66JY2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ino80dQ66JY2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ino80dQ66JY2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80dQ66JY2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80dQ66JY2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80dQ66JY2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ino80dQ66JY2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ino80dQ66JY2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ino80dQ66JY2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ino80dQ66JY2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.7 ms