Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gja3Q64448 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gja3Q64448 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gja3Q64448 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gja3Q64448 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gja3Q64448 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gja3Q64448 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gja3Q64448 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gja3Q64448 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gja3Q64448 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gja3Q64448 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gja3Q64448 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gja3Q64448 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Gja3Q64448 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gja3Q64448 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gja3Q64448 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gja3Q64448 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gja3Q64448 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gja3Q64448 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gja3Q64448 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Gja3Q64448 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Gja3Q64448 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gja3Q64448 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gja3Q64448 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gja3Q64448 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gja3Q64448 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gja3Q64448 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gja3Q64448 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gja3Q64448 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gja3Q64448 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gja3Q64448 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Gja3Q64448 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gja3Q64448 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gja3Q64448 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gja3Q64448 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gja3Q64448 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gja3Q64448 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gja3Q64448 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gja3Q64448 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Gja3Q64448 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gja3Q64448 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gja3Q64448 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gja3Q64448 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gja3Q64448 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Gja3Q64448 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gja3Q64448 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gja3Q64448 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Gja3Q64448 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gja3Q64448 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gja3Q64448 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gja3Q64448 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gja3Q64448 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Gja3Q64448 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gja3Q64448 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gja3Q64448 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gja3Q64448 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gja3Q64448 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gja3Q64448 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gja3Q64448 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gja3Q64448 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gja3Q64448 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gja3Q64448 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Gja3Q64448 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gja3Q64448 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gja3Q64448 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gja3Q64448 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gja3Q64448 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gja3Q64448 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gja3Q64448 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gja3Q64448 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gja3Q64448 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gja3Q64448 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gja3Q64448 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gja3Q64448 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gja3Q64448 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gja3Q64448 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Gja3Q64448 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gja3Q64448 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gja3Q64448 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gja3Q64448 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gja3Q64448 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gja3Q64448 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gja3Q64448 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gja3Q64448 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gja3Q64448 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gja3Q64448 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gja3Q64448 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gja3Q64448 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gja3Q64448 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gja3Q64448 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Gja3Q64448 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gja3Q64448 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gja3Q64448 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gja3Q64448 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gja3Q64448 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gja3Q64448 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Gja3Q64448 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gja3Q64448 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gja3Q64448 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gja3Q64448 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms