Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PatjQ63ZW7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PatjQ63ZW7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PatjQ63ZW7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PatjQ63ZW7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PatjQ63ZW7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PatjQ63ZW7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PatjQ63ZW7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PatjQ63ZW7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PatjQ63ZW7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PatjQ63ZW7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PatjQ63ZW7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PatjQ63ZW7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PatjQ63ZW7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PatjQ63ZW7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PatjQ63ZW7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PatjQ63ZW7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PatjQ63ZW7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PatjQ63ZW7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PatjQ63ZW7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PatjQ63ZW7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PatjQ63ZW7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PatjQ63ZW7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PatjQ63ZW7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PatjQ63ZW7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PatjQ63ZW7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PatjQ63ZW7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PatjQ63ZW7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PatjQ63ZW7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PatjQ63ZW7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PatjQ63ZW7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PatjQ63ZW7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PatjQ63ZW7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PatjQ63ZW7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PatjQ63ZW7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PatjQ63ZW7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PatjQ63ZW7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PatjQ63ZW7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PatjQ63ZW7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PatjQ63ZW7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PatjQ63ZW7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PatjQ63ZW7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PatjQ63ZW7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PatjQ63ZW7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PatjQ63ZW7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PatjQ63ZW7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PatjQ63ZW7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PatjQ63ZW7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PatjQ63ZW7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PatjQ63ZW7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PatjQ63ZW7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PatjQ63ZW7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PatjQ63ZW7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PatjQ63ZW7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PatjQ63ZW7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PatjQ63ZW7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PatjQ63ZW7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PatjQ63ZW7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PatjQ63ZW7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PatjQ63ZW7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PatjQ63ZW7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PatjQ63ZW7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PatjQ63ZW7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PatjQ63ZW7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PatjQ63ZW7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PatjQ63ZW7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PatjQ63ZW7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PatjQ63ZW7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms