Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3gl2Q62420 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3gl2Q62420 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sh3gl2Q62420 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sh3gl2Q62420 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh3gl2Q62420 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3gl2Q62420 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3gl2Q62420 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3gl2Q62420 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3gl2Q62420 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3gl2Q62420 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3gl2Q62420 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3gl2Q62420 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3gl2Q62420 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3gl2Q62420 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3gl2Q62420 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3gl2Q62420 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3gl2Q62420 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3gl2Q62420 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3gl2Q62420 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3gl2Q62420 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3gl2Q62420 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3gl2Q62420 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3gl2Q62420 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3gl2Q62420 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3gl2Q62420 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3gl2Q62420 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3gl2Q62420 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3gl2Q62420 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3gl2Q62420 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3gl2Q62420 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms