Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp4Q60972 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp4Q60972 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rbbp4Q60972 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbbp4Q60972 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rbbp4Q60972 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbbp4Q60972 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbbp4Q60972 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbbp4Q60972 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbbp4Q60972 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbbp4Q60972 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rbbp4Q60972 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbbp4Q60972 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbbp4Q60972 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rbbp4Q60972 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp4Q60972 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp4Q60972 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbbp4Q60972 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbbp4Q60972 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbbp4Q60972 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbbp4Q60972 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbbp4Q60972 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbbp4Q60972 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbbp4Q60972 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbbp4Q60972 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbbp4Q60972 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbbp4Q60972 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbbp4Q60972 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rbbp4Q60972 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbbp4Q60972 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbbp4Q60972 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbbp4Q60972 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbbp4Q60972 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbbp4Q60972 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbbp4Q60972 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbbp4Q60972 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbbp4Q60972 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbbp4Q60972 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbbp4Q60972 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbbp4Q60972 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbbp4Q60972 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbbp4Q60972 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms