Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nr1d1Q3UV55 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nr1d1Q3UV55 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nr1d1Q3UV55 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nr1d1Q3UV55 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nr1d1Q3UV55 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nr1d1Q3UV55 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nr1d1Q3UV55 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nr1d1Q3UV55 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nr1d1Q3UV55 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nr1d1Q3UV55 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nr1d1Q3UV55 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nr1d1Q3UV55 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nr1d1Q3UV55 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr1d1Q3UV55 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr1d1Q3UV55 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr1d1Q3UV55 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr1d1Q3UV55 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr1d1Q3UV55 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr1d1Q3UV55 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr1d1Q3UV55 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr1d1Q3UV55 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr1d1Q3UV55 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr1d1Q3UV55 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr1d1Q3UV55 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr1d1Q3UV55 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nr1d1Q3UV55 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nr1d1Q3UV55 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nr1d1Q3UV55 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nr1d1Q3UV55 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nr1d1Q3UV55 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr1d1Q3UV55 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr1d1Q3UV55 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr1d1Q3UV55 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nr1d1Q3UV55 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nr1d1Q3UV55 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nr1d1Q3UV55 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nr1d1Q3UV55 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nr1d1Q3UV55 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nr1d1Q3UV55 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nr1d1Q3UV55 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nr1d1Q3UV55 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nr1d1Q3UV55 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nr1d1Q3UV55 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nr1d1Q3UV55 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nr1d1Q3UV55 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nr1d1Q3UV55 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nr1d1Q3UV55 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nr1d1Q3UV55 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 368.3 ms