Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTE2

Gm428, Predicted gene 428, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm428Q3UTE2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm428Q3UTE2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm428Q3UTE2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm428Q3UTE2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm428Q3UTE2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm428Q3UTE2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm428Q3UTE2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm428Q3UTE2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm428Q3UTE2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm428Q3UTE2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm428Q3UTE2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm428Q3UTE2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm428Q3UTE2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm428Q3UTE2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm428Q3UTE2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm428Q3UTE2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm428Q3UTE2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm428Q3UTE2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm428Q3UTE2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm428Q3UTE2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm428Q3UTE2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm428Q3UTE2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm428Q3UTE2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm428Q3UTE2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm428Q3UTE2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm428Q3UTE2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm428Q3UTE2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm428Q3UTE2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm428Q3UTE2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm428Q3UTE2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm428Q3UTE2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm428Q3UTE2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm428Q3UTE2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm428Q3UTE2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm428Q3UTE2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm428Q3UTE2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm428Q3UTE2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm428Q3UTE2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm428Q3UTE2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm428Q3UTE2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm428Q3UTE2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm428Q3UTE2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm428Q3UTE2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm428Q3UTE2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm428Q3UTE2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm428Q3UTE2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm428Q3UTE2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm428Q3UTE2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm428Q3UTE2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm428Q3UTE2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm428Q3UTE2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm428Q3UTE2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm428Q3UTE2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm428Q3UTE2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm428Q3UTE2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm428Q3UTE2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm428Q3UTE2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm428Q3UTE2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm428Q3UTE2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm428Q3UTE2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm428Q3UTE2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm428Q3UTE2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm428Q3UTE2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm428Q3UTE2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm428Q3UTE2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm428Q3UTE2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm428Q3UTE2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm428Q3UTE2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm428Q3UTE2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm428Q3UTE2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm428Q3UTE2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gm428Q3UTE2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm428Q3UTE2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm428Q3UTE2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm428Q3UTE2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm428Q3UTE2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm428Q3UTE2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm428Q3UTE2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm428Q3UTE2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm428Q3UTE2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm428Q3UTE2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm428Q3UTE2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm428Q3UTE2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm428Q3UTE2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm428Q3UTE2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm428Q3UTE2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm428Q3UTE2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm428Q3UTE2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm428Q3UTE2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm428Q3UTE2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm428Q3UTE2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm428Q3UTE2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm428Q3UTE2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm428Q3UTE2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm428Q3UTE2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm428Q3UTE2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm428Q3UTE2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm428Q3UTE2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm428Q3UTE2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm428Q3UTE2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms