Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ell2Q3UKU1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ell2Q3UKU1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ell2Q3UKU1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ell2Q3UKU1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ell2Q3UKU1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ell2Q3UKU1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ell2Q3UKU1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ell2Q3UKU1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ell2Q3UKU1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ell2Q3UKU1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ell2Q3UKU1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ell2Q3UKU1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ell2Q3UKU1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ell2Q3UKU1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ell2Q3UKU1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ell2Q3UKU1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ell2Q3UKU1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ell2Q3UKU1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ell2Q3UKU1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ell2Q3UKU1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ell2Q3UKU1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ell2Q3UKU1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ell2Q3UKU1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ell2Q3UKU1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ell2Q3UKU1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ell2Q3UKU1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ell2Q3UKU1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ell2Q3UKU1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ell2Q3UKU1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ell2Q3UKU1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ell2Q3UKU1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ell2Q3UKU1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ell2Q3UKU1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ell2Q3UKU1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ell2Q3UKU1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ell2Q3UKU1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ell2Q3UKU1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ell2Q3UKU1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ell2Q3UKU1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ell2Q3UKU1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ell2Q3UKU1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ell2Q3UKU1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ell2Q3UKU1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ell2Q3UKU1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ell2Q3UKU1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ell2Q3UKU1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ell2Q3UKU1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ell2Q3UKU1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ell2Q3UKU1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ell2Q3UKU1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ell2Q3UKU1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ell2Q3UKU1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ell2Q3UKU1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ell2Q3UKU1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ell2Q3UKU1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ell2Q3UKU1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ell2Q3UKU1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ell2Q3UKU1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ell2Q3UKU1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Ell2Q3UKU1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ell2Q3UKU1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ell2Q3UKU1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ell2Q3UKU1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ell2Q3UKU1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ell2Q3UKU1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ell2Q3UKU1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ell2Q3UKU1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ell2Q3UKU1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ell2Q3UKU1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ell2Q3UKU1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ell2Q3UKU1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ell2Q3UKU1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ell2Q3UKU1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ell2Q3UKU1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ell2Q3UKU1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ell2Q3UKU1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ell2Q3UKU1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ell2Q3UKU1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ell2Q3UKU1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ell2Q3UKU1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ell2Q3UKU1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ell2Q3UKU1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ell2Q3UKU1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ell2Q3UKU1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ell2Q3UKU1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ell2Q3UKU1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ell2Q3UKU1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ell2Q3UKU1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ell2Q3UKU1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ell2Q3UKU1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ell2Q3UKU1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ell2Q3UKU1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ell2Q3UKU1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ell2Q3UKU1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ell2Q3UKU1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ell2Q3UKU1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ell2Q3UKU1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ell2Q3UKU1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ell2Q3UKU1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms