Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rnf180Q3U827 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rnf180Q3U827 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rnf180Q3U827 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rnf180Q3U827 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rnf180Q3U827 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rnf180Q3U827 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rnf180Q3U827 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rnf180Q3U827 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rnf180Q3U827 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rnf180Q3U827 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rnf180Q3U827 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rnf180Q3U827 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rnf180Q3U827 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rnf180Q3U827 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rnf180Q3U827 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rnf180Q3U827 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rnf180Q3U827 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rnf180Q3U827 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rnf180Q3U827 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rnf180Q3U827 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rnf180Q3U827 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rnf180Q3U827 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rnf180Q3U827 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rnf180Q3U827 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rnf180Q3U827 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rnf180Q3U827 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rnf180Q3U827 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnf180Q3U827 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnf180Q3U827 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnf180Q3U827 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rnf180Q3U827 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rnf180Q3U827 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rnf180Q3U827 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rnf180Q3U827 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rnf180Q3U827 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rnf180Q3U827 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnf180Q3U827 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnf180Q3U827 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnf180Q3U827 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rnf180Q3U827 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rnf180Q3U827 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Rnf180Q3U827 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rnf180Q3U827 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rnf180Q3U827 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rnf180Q3U827 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rnf180Q3U827 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rnf180Q3U827 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rnf180Q3U827 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rnf180Q3U827 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rnf180Q3U827 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnf180Q3U827 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnf180Q3U827 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnf180Q3U827 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnf180Q3U827 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnf180Q3U827 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rnf180Q3U827 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rnf180Q3U827 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rnf180Q3U827 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rnf180Q3U827 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rnf180Q3U827 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rnf180Q3U827 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rnf180Q3U827 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rnf180Q3U827 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rnf180Q3U827 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
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Rnf180Q3U827 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Rnf180Q3U827 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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Rnf180Q3U827 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rnf180Q3U827 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rnf180Q3U827 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rnf180Q3U827 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rnf180Q3U827 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rnf180Q3U827 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rnf180Q3U827 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnf180Q3U827 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnf180Q3U827 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnf180Q3U827 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rnf180Q3U827 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rnf180Q3U827 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rnf180Q3U827 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rnf180Q3U827 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rnf180Q3U827 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rnf180Q3U827 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rnf180Q3U827 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rnf180Q3U827 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rnf180Q3U827 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rnf180Q3U827 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rnf180Q3U827 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rnf180Q3U827 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rnf180Q3U827 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rnf180Q3U827 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnf180Q3U827 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnf180Q3U827 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnf180Q3U827 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnf180Q3U827 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnf180Q3U827 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnf180Q3U827 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rnf180Q3U827 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
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